یکی دیگر از عوامل خطر اقدام به خودکشی عوامل معنوی است. وجود معنویت در انسان و ایمان به خدا باعث جهان‌بینی روشن و صحیح می شود و هدف و معنای زندگی را درک می‌کند و فقدان آن موجب می‌شود احساس کند که زندگی تکراری است و هدف و معنایی ندارد.
در نتیجه این احساس پوچی ممکن است فرد با وجود در اختیار داشتن بهترین امکانات،برای رهایی از این پوچی و روزهای تکراری،اقدام به خودکشی کند.
از طرفی لذّت محوری و فقدان معادباوری موجب می‌شود که هدف فرد در زندگی کسب نشاط و لذّت باشد، بنابراین هنگامی که مشکلاتی ایجاد می‌شود، مثلا دچار مشکلات اقتصادی و یا معلولیّت جسمی می‌شود، به آسانی به خودکشی اقدام می‌کند زیرا معتقد است که زندگی که در آن لذّت نباشد، فایده‌ای ندارد و باور دارد که مرگ پایان زندگی است.
همچنین در مواردی نیز در اثر خداباوری ضعیف و اشتباه و یا شناخت نامناسب دین و دینداری،در موقعیت هایی فرد احساس گناه و آلودگی افراطی داشته و از بخشش خدا ناامید می شود و فکر می‌کند که خداوند او را طرد کرده و در نتیجه دست به خودکشی می‌زند.
